무인기(드론)는 항시 개방된 상태의 무선 네트웤를 이용하고 있고 일부 무인기의 경우 데이터 프로토콜도 Mavlink등과 같은 공개 프로토콜을 사용하고 있어 사이버 및 무선 보안 공격에 대한 취약성이 부각되고 있는 실정이다. 스푸핑 공격의 경우는 무인기의 제어권을 빼앗기기 때문에 무인기 강제 파손과 무인기를 이용한 이차 피해가 발생할 수 있어 재밍보다 더 피해가 크다. 본 논문에서는 이러한 스푸핑 방지를 위한 독립형 무인기 데이터링크 대칭형 암호화 시스템에 대해서 설명한다. 또한, 체계관리의 편리성과 효율성을 증대하기 위하여 암호화 시스템에 적용한 체계관리툴에 대하여 설명하였다.